Le bassin versant de l’Aulne et de l’Hyères de par la diversité des paysages qui le compose conserve aussi des secteurs plus préservés possédant un patrimoine Naturel reconnu. C’est le cas notamment de la vallée de l’Aulne classée en zone Natura 2000, ou de nombreux sites naturels situés en tête de bassin versant comme les Landes des Monts d’Arrée ou même de sites littoraux préservés comme l’estuaire de l’Aulne.

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